Conozca al hombre a cargo de acelerar la ciencia en la Iniciativa Chan Zuckerberg

Jeremy Freeman tiene la misión de ayudar a los científicos a manipular y difundir datos de forma más rápida y sencilla.

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Hasta hace cuatro meses, Jeremy Freeman trabajó en el laboratorio de neurociencia de Janelia, un campus de investigación sin fines de lucro en Washington, DC. Entonces los Zuckerberg vinieron a llamar.

Freeman es ahora el gerente de biología computacional en la Iniciativa Chan Zuckerberg (CZI), una filantropía creada por Priscilla Chan y su esposo Mark Zuckerberg con un objetivo modesto: curar, prevenir o controlar todas las enfermedades para fines de siglo.

“Si eres como yo, suena como una meta loca, pero es bueno tener metas locas”, dijo Freeman a la audiencia en la conferencia DyN Noticias Health en Londres. “Sin embargo, si dijera que lograríamos estas cosas en miles de años, no parecería tan loco”.

El desafío para el trabajo científico de Freeman y CZI en su conjunto es acelerar este proceso. “Gran parte de la biología está realmente limitada y bloqueada por la forma en que procesamos los datos y difundimos nuestro conocimiento”, dijo. Los investigadores de laboratorio solían pasar el 80% de su tiempo haciendo experimentos y el 20% examinando datos. Ahora, argumentó Freeman, esa orden fue revocada. “Cada laboratorio lo hace de forma más o menos independiente, por lo que hay mucha reinvención. Es muy difícil compartir y reutilizar. “

La experiencia de Freeman con Janelia le dio una ventaja. Mientras estuvo allí, trabajó en un proyecto para agilizar y simplificar la recopilación, análisis y difusión de datos de la investigación neurológica del centro. “En el proceso, comenzamos a darnos cuenta de que los problemas en los que estábamos trabajando no eran específicos de la neurología”, dijo. La verdadera pregunta: ¿cómo se puede aplicar esto a todas las ciencias?

“No podemos curar algo que no entendemos, y hay mucho sobre biología que no entendemos”, explicó Freeman. “Existe una gran oportunidad de utilizar software y tecnología para hacer que la ciencia sea más eficiente, eficaz y colaborativa”.

Gran parte del trabajo inicial de CZI fue escuchar a la comunidad. Ya se han realizado talleres en las áreas de identidad en las que la tecnología podría incidir en la forma en que la comunidad científica gestiona los datos. “También tenemos un equipo muy grande y de rápido crecimiento de ingenieros de software en la iniciativa”, dijo Freeman.

Uno de los primeros proyectos de CZI es el Atlas de células humanas, un esfuerzo colaborativo para construir un “mapa de referencia completo” de todas las células del cuerpo humano. “No sabemos mucho sobre las diferencias fundamentales entre las células”, dijo Freeman. Pero la nueva tecnología, continuó, permite a los tecnólogos y científicos clasificar las células a escala. Para ayudar a acelerar el proyecto, CZI ha lanzado una convocatoria de solicitudes para proyectos piloto que luego ayudará a desarrollar. Una vez finalizado, todos los datos y la tecnología serán de código abierto.

Aparte de la forma en que se recopilan los datos, otro gran desafío en CZI es la difusión. La investigación científica todavía se comparte utilizando un sistema desarrollado hace más de cien años: el trabajo académico. “Así es como difundimos el conocimiento, es un documento PDF”, dijo Freeman. Argumentó que los datos, el código y los elementos interactivos de la investigación deberían ser todos interactivos. “Existe una necesidad obvia de modernizar y expandir la tecnología que usamos”, dijo Freeman.

Aunque está separado de Facebook, existe el temor de que el enorme presupuesto y los recursos de CZI puedan darle una ventaja injusta. Pero Freeman dijo que ese no es el punto. “Mi instinto es que no habrá un solo sistema”, dijo. “Personalmente, estoy a favor de un sistema de código abierto menos federado. La clave es llevar los principios de la ingeniería de software de calidad a la ciencia”.

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